Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 CHN2-220ENST00000474070 754 ntTSL 510.47□□□□□ -0.734e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ZNF788-205ENST00000596096 566 ntTSL 410.45□□□□□ -0.744e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SRGAP2C-202ENST00000367123 7204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.744e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 RALGPS1-209ENST00000438723 4858 ntTSL 510.43□□□□□ -0.744e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ZNF232-208ENST00000575898 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.744e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 QTRT2-201ENST00000281273 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.764e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CSGALNACT1-203ENST00000454498 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.764e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ADCY7-205ENST00000563677 557 ntTSL 410.3□□□□□ -0.764e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ARNTL2-202ENST00000266503 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.764e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 C12orf57-207ENST00000545581 556 ntTSL 310.28□□□□□ -0.764e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 FYN-210ENST00000471959 932 ntTSL 510.27□□□□□ -0.774e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 DDX41-209ENST00000508279 776 ntTSL 510.26□□□□□ -0.774e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ACTR8-205ENST00000495993 517 ntTSL 310.24□□□□□ -0.774e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ARNTL2-201ENST00000261178 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.774e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 DST-206ENST00000370788 17657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.774e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MBTPS1-206ENST00000563231 546 ntTSL 510.2□□□□□ -0.784e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 APOL4-211ENST00000613247 3142 ntTSL 510.19□□□□□ -0.784e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SMARCD1-205ENST00000548573 2095 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.784e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 LDHB-204ENST00000450584 732 ntTSL 310.16□□□□□ -0.784e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 APOL4-207ENST00000449084 1052 ntTSL 510.12□□□□□ -0.794e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 KIAA1328-209ENST00000592521 1190 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.84e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 IKZF4-207ENST00000548601 696 ntTSL 310.06□□□□□ -0.84e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CNNM3-203ENST00000465224 2607 ntTSL 1 (best)10.04□□□□□ -0.84e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 JPX-209ENST00000602920 625 ntTSL 210.04□□□□□ -0.84e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 C12orf57-205ENST00000542222 640 ntTSL 210.03□□□□□ -0.84e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.824e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 LMLN-201ENST00000330198 7043 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.824e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MTCP1-201ENST00000362018 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.834e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 AP000446.1-202ENST00000534572 453 ntTSL 39.87□□□□□ -0.834e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 DST-207ENST00000421834 18030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.834e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CAMK2G-211ENST00000474131 512 ntTSL 1 (best)9.84□□□□□ -0.834e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MOCOS-201ENST00000261326 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.834e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TIMP2-202ENST00000536189 3415 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.844e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SLC37A1-204ENST00000419522 568 ntTSL 1 (best)9.81□□□□□ -0.844e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MIR4435-2HG-210ENST00000442293 546 ntTSL 59.79□□□□□ -0.844e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 HAUS8-208ENST00000601564 826 ntTSL 39.79□□□□□ -0.844e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 FAM9B-204ENST00000461107 3592 ntTSL 29.78□□□□□ -0.844e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 DAB2-213ENST00000512525 693 ntTSL 39.77□□□□□ -0.854e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CSGALNACT1-201ENST00000332246 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.854e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CAMK2G-204ENST00000351293 3563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.864e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 FOXP4-AS1-204ENST00000440194 196 ntTSL 39.65□□□□□ -0.864e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CAMK2G-214ENST00000492020 773 ntTSL 59.59□□□□□ -0.874e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ZNF232-204ENST00000572468 724 ntTSL 39.57□□□□□ -0.884e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SAP30BP-208ENST00000578909 678 ntTSL 59.56□□□□□ -0.884e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 APOL4-208ENST00000457630 520 ntTSL 59.56□□□□□ -0.884e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TCF20-202ENST00000359486 7410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.894e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MIR4435-2HG-217ENST00000604981 759 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.894e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 STK3-205ENST00000518582 725 ntTSL 39.46□□□□□ -0.94e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 NT5C2-201ENST00000343289 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.94e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ZNF788-204ENST00000595703 568 ntTSL 49.45□□□□□ -0.94e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ANAPC1-202ENST00000427997 5047 ntTSL 1 (best)9.41□□□□□ -0.94e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ANAPC1-201ENST00000341068 8262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.94e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TDP1-202ENST00000393452 2370 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.914e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.914e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 LDHB-202ENST00000396075 744 ntTSL 39.3□□□□□ -0.924e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 RFC2-206ENST00000479105 957 ntTSL 59.29□□□□□ -0.924e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SNX27-201ENST00000368838 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.924e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 USP46-207ENST00000508499 1419 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.934e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TDP1-210ENST00000554976 3040 ntTSL 29.27□□□□□ -0.934e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 AC104123.1-202ENST00000511775 581 ntTSL 4 BASIC9.23□□□□□ -0.934e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MIR4435-2HG-208ENST00000439494 707 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.944e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 COL6A5-202ENST00000312481 9226 ntTSL 1 (best)9.16□□□□□ -0.944e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ICK-201ENST00000350082 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.944e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TEX10-203ENST00000477648 4457 ntTSL 29.12□□□□□ -0.954e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.964e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ACTN1-212ENST00000554158 571 ntTSL 49.06□□□□□ -0.964e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SNX29-208ENST00000569801 540 ntTSL 49.05□□□□□ -0.964e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 JAZF1-205ENST00000447620 585 ntTSL 49.05□□□□□ -0.964e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TDP1-204ENST00000545686 2488 ntTSL 1 (best)9.04□□□□□ -0.964e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TDP1-203ENST00000393454 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.964e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 HDGFL3-205ENST00000568129 426 ntTSL 28.94□□□□□ -0.984e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 HELLS-206ENST00000394045 2699 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.984e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 BPTF-203ENST00000335221 2627 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.994e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 GNL3L-203ENST00000489691 895 ntTSL 38.87□□□□□ -0.994e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SAP30BP-206ENST00000578354 574 ntTSL 48.85□□□□□ -0.994e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 DST-224ENST00000521821 735 ntTSL 28.84□□□□□ -0.994e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TDP1-201ENST00000335725 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -14e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SLC5A1-201ENST00000266088 5061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -14e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 JPX-211ENST00000602985 476 ntTSL 38.72□□□□□ -1.014e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 QTRT2-207ENST00000467703 3060 ntTSL 1 (best)8.71□□□□□ -1.024e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 QTRT2-215ENST00000493014 1046 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.024e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 JPX-210ENST00000602938 581 ntTSL 28.64□□□□□ -1.034e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 JPX-204ENST00000602294 502 ntTSL 28.56□□□□□ -1.044e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 LMLN-202ENST00000332636 1812 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.044e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ETS2-204ENST00000456966 972 ntTSL 38.52□□□□□ -1.054e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 IQUB-201ENST00000324698 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.054e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 COL6A5-201ENST00000265379 9214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.064e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MTFR1-206ENST00000518636 541 ntTSL 38.44□□□□□ -1.064e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.064e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MCF2L2-212ENST00000488149 7813 ntTSL 28.43□□□□□ -1.064e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.064e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SORCS1-202ENST00000344440 3009 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.064e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 APBB2-224ENST00000513140 4166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.074e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SAP30BP-210ENST00000579864 868 ntTSL 38.36□□□□□ -1.074e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SRGAP2-202ENST00000572793 498 ntTSL 58.31□□□□□ -1.084e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 LRP1-206ENST00000554118 418 ntTSL 28.3□□□□□ -1.084e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 RFC2-208ENST00000485545 847 ntTSL 38.3□□□□□ -1.084e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ARNTL2-203ENST00000311001 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.084e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ZCCHC2-203ENST00000585949 2429 ntTSL 28.29□□□□□ -1.084e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 BSCL2-219ENST00000526426 353 ntTSL 38.14□□□□□ -1.114e-7■■■■■ 133.7
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1585.1 ms