Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms