Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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TIMM17BO60830 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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