Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms