Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEFVO15553 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEFVO15553 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEFVO15553 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEFVO15553 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEFVO15553 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEFVO15553 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEFVO15553 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEFVO15553 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEFVO15553 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEFVO15553 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEFVO15553 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MEFVO15553 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEFVO15553 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEFVO15553 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEFVO15553 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEFVO15553 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEFVO15553 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEFVO15553 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEFVO15553 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MEFVO15553 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEFVO15553 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEFVO15553 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MEFVO15553 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MEFVO15553 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEFVO15553 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEFVO15553 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEFVO15553 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEFVO15553 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEFVO15553 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEFVO15553 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MEFVO15553 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEFVO15553 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEFVO15553 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEFVO15553 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEFVO15553 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEFVO15553 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEFVO15553 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEFVO15553 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEFVO15553 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MEFVO15553 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEFVO15553 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MEFVO15553 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MEFVO15553 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MEFVO15553 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MEFVO15553 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MEFVO15553 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MEFVO15553 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MEFVO15553 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MEFVO15553 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MEFVO15553 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
MEFVO15553 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MEFVO15553 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms