Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAPO00193 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAPO00193 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAPO00193 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAPO00193 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAPO00193 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAPO00193 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAPO00193 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAPO00193 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAPO00193 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAPO00193 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAPO00193 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMAPO00193 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMAPO00193 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMAPO00193 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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