Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L13C9JLJ4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L13C9JLJ4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms