Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRRT4C9JH25 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRRT4C9JH25 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRRT4C9JH25 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRRT4C9JH25 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRRT4C9JH25 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRRT4C9JH25 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRRT4C9JH25 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRRT4C9JH25 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRRT4C9JH25 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRRT4C9JH25 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRRT4C9JH25 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRRT4C9JH25 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRRT4C9JH25 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRRT4C9JH25 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRRT4C9JH25 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRRT4C9JH25 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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