Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PATL2C9JE40 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms