Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVV-2B6SEH9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms