Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms