Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms