Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms