Protein–RNA interactions for Protein: A8MTJ6

FOXI3, Forkhead box protein I3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI3A8MTJ6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI3A8MTJ6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms