Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L4A6NEF3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms