Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms