Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA6A0AVT1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms