Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms