Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPN7Q9Y6W3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms