Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms