Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNQ9UQP3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms