Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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