Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms