Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ALKQ9UM73 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALKQ9UM73 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms