Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.8 ms