Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms