Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms