Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms