Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms