Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms