Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms