Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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