Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms