Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms