Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms