Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN6Q9NWW5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms