Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO28Q9NVF7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms