Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UFSP2Q9NUQ7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms