Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms