Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC1Q9NRX5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms