Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms