Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ89

C12orf4, Protein C12orf4, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf4Q9NQ89 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C12orf4Q9NQ89 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms