Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TUFT1Q9NNX1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms