Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKRIP1Q9H875 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms