Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms