Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTR3CQ9C0K3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTR3CQ9C0K3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTR3CQ9C0K3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTR3CQ9C0K3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms