Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms