Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
VN1R3Q9BXE9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms