Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOL6Q9BWW8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOL6Q9BWW8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOL6Q9BWW8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOL6Q9BWW8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOL6Q9BWW8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOL6Q9BWW8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOL6Q9BWW8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms