Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms